ハイスループットスクリーニング

現代のハイスループットスクリーニングは、標的ベースの生化学的なスクリーニングによって実施されています。Genedata Screenerは、吸光度や発光・蛍光のエンドポイントアッセイといった生化学的アッセイに対応しており、FLIPRやレポーターアッセイなど、生きたままの細胞からのシグナルを測定する情報に富んだアッセイを扱うことも容易です。さらには、シングルポイントならびに時系列データの処理も、プレートベースのスクリーニングで最適化できます。

• Z’ファクターのようなQCの測定で重要な値を自動計算
• 業界標準のプレートリーダーからデータを直接取り込み
• 時系列測定実験の生データのグラフを容易に閲覧、重ね合わせやグラフを使い自動計算・フィッティング

創薬標的ならびに毒性試験の対象として重要なイオンチャネルのアッセイは、オートパッチクランプによって細胞レベルで高解像度かつ大規模に扱うことができます。イオンチャネルアッセイ機器の革新によりスループットが大幅に改善した一方で、それらのデータの解析がアッセイ全体のボトルネックとなっています。

このボトルネックを解消するのが、Genedata Screenerのイオンチャネルスクリーニング機能です。最新のイオンチャネルアッセイ機器にも対応しており、以下の機能を提供しています。

• 複雑なデータ正規化や、数百万の化合物を扱うパッチクランプアッセイから出力される時系列データの統合・フィッティングを自動化することで、データの取り扱い・解析に要する時間を最大95％削減
• 解析ワークフロー内の任意の時点で臨機応変に計算内容を調整し、下流の結果に反映することで、再現性が担保された高品質の解析を実施
• イオンチャネルアッセイの時系列グラフを解析結果と並列で表示、あるいはプレート上に一覧で表示することで、QC・評価を加速

Learn how:

1. Pfizer社とGenentech社では、Genedata Screenerを用いて数百万の化合物を扱うハイスループットパッチクランプアッセイを効率化・自動化しています。
2. Axxam社では、Genedata Screenerを用いてカルシウムオシレーションアッセイのルーチンアプリケーションが可能な拡張性・堅牢性の高いデータ解析ワークフローを構築しています。