全てのデータの一元管理
生データファイルから処理済み・統一化済みデータ、解析対応のデータセットやレポートまで、全てのデータを高性能かつセキュアなデータ管理システムに集約します。また、LIMSやサンプル管理システムを含め、外部ファイルシステムや公共およびプライベートデータベースからのデータの取り込みも容易に自動化可能です。
Genedata Profilerは、あなたのデータをセキュアにFAIR（Findable=見つけられる、Accessible=アクセスできる、Interoperable=相互運用できる、Reusable=再利用できる）に管理します。CROなどの外部パートナーとの連携やチーム内のデータ共有において、センシティブな患者データをきめ細やかなユーザーアクセス制御と権限設定によりセキュアに管理します。詳細はこちら。
多種多様な生データの高速処理
次世代シーケンス（NGS）、マイクロアレイ、質量分析（MS）、免疫組織化学（IHC）など、どのような実験から得た生データであっても、その処理ならびに品質管理（QC）を自動化できます。複雑な過程からなる一連の解析は、あらかじめ最適化されたワークフローを使用することで簡単に処理できます。何百ものアルゴリズムが用意されている上、ユーザー独自のアルゴリズムを組み込むことも可能です。
ドラッグアンドドロップによる簡単操作でこれらを組み合わせ、オリジナルワークフローを構築することができます。あとはファイルを追加し、パラメータを指定し、ワークフローの実行ボタンを押すだけで、何百ものゲノムが、数日ではなく数時間の単位で解析されます。データは各ステップ毎に可視化され確認できるため、生データのライフサイクル全体を管理することが可能です。（最新の機能についてはこちら）
統合データセットの活用
Genedata Profilerでは、複数のプロジェクトに由来するデータも容易に統合できます。自動化ワークフローによりフォーマットや単位などの違いを統一化し、またサンプルごとにマルチオミクス・バイオマーカー・クリニカルデータを紐づけていきます。これらの過程を経て構築された統合データセットこそが、次の研究ステップへ価値ある知見をもたらします。最も注視する解析対象にアプローチするため、簡単な操作でデータテーブルを選択し、絞り込み、別のテーブルと融合させることも可能です。
研究者や開発担当者は、高機能な解析データベースとユーザー毎の権限設定によって、高速かつ安全な方法でデータへアクセスし、探索を進めることができます。患者の同意撤回を含め、解析用データセットはリアルタイムで更新されるため、センシティブな患者データも常に保護された状態で管理されます。
データ探索と効果的な可視化
Genedata Profilerに搭載されている「Analyst」は、洗練された統計解析を可能にする双方向性データマイニング・可視化ツールです。要約統計から生存分析、機械学習アルゴリズムまで、膨大な数の統計手法が搭載されています。
またRStudio、Tableau、Spotfire、PowerBI、Jupyterなど、他のデータ可視化用解析サービスへ接続することも可能です。柔軟なAPIにより、希望のサードパーティーツールと連携し、ユーザー独自のダッシュボードを自由に作成できます。選択したツールにかかわらず、全てのデータはGenedata Profiler側で常にセキュアに管理されます。
This partnership provides us with innovative approaches to drive the integration of biomarker data within and across our clinical programs including the digitalizing of translational workflows associated with clinical studies.
With the scientific support of Genedata and its Genedata Profiler software, Egis has developed the PREDYSTIC® Infliximab RA Kit to guide the treatment of RA patients, allowing therapies to be matched to the patients who will derive true benefits from treatment.
The Genedata Profiler platform is used productively in a validated environment and is helping to democratize access to integrated data in the translational research and clinical settings.
Working closely with Genedata, we have generated a digital biomarker research platform that will enable Merck scientists to better utilize clinical and translational data to generate innovative ideas for new biomarkers and drug targets.
We are pleased to have found a reliable partner who provided us with expert knowledge in big multi-omics data analysis to accelerate our search for precision biomarkers to prognosticate disease course and to guide early and effective personalized treatment decisions.
We chose Genedata Profiler because it is the end-to-end enterprise software able to harmonize our dispersed data analysis pipelines, enhancing our capacity to analyze large amounts of high-dimensional ‘omics data emerging from our rapidly growing number of translational and clinical research projects.
As we expect our clinical and pre-clinical programs and pipeline to continue to grow, we look forward to utilizing Genedata Profiler and Genedata Managed IT Services to assist us in our mission to develop safe, targeted, effective therapeutics for cancer patients.
