ハイコンテント／マルチプレックスアッセイ

in vitro表現型スクリーニングにおいては、しばしば数値だけでは細胞の情報を全て捉えきれないことがあり、多くの場合は画像に大きく依存しています。Genedata Screenerは、1ウェル当たり数百のパラメーターと数千枚のプレートを扱うハイコンテントスクリーニングのデータを一つのソフトウェアでアクセス可能にし、画像データを解析作業中に参照できます。以下の機能を提供しています。

• 元の画像と計算結果を並列表示し、表現型の変化や生物学的な現象を瞬時に確認
• 細胞の密度プロットによって迅速に興味深いあるいは疑うべき結果を特定
• 細胞集団を定義、インタラクティブなヒストグラムで細胞のデータをウェル単位に統合
• より詳細に表現型を理解するために複雑な複数のパラメーターを解析
• ディープラーニングを用いた画像解析ソリューションであるGenedata Imagence^®との連携によって、複雑な表現型の同定を自動化

Genedata Screenerは、Amgen社などで組織全体のハイコンテントスクリーニングを統合し、迅速に精密な画像QCを実現しています。

フローサイトメトリーとFACSはサンプルのスループットを大幅に向上し、複雑な実験を可能にしてきた高分子創薬の重要な技術です。現在のHT-Flowスクリーニングでは、多くのサンプルを用い、処理条件毎に数千におよぶ単一の細胞の様々な特徴を捉えます。そのため、膨大なデータを解析し、複雑な結果を分かりやすくまとめることができるソリューションが必要となります。

Genedata Screenerは、自動化ならびに標準化された解析をHT-Flowスクリーニング全体に適用可能です。Genedata Screener for HT-Flow機能では、HT-Flow機器から出力されたデータを直接読み込み、正規化します。現在、以下の機能を提供しています。

• 単一の細胞、ウェル、プレートなどあらゆる段階の結果へ即時にアクセスすることで、簡便に結果を比較・評価
• ヒストグラムや密度プロットでゲーティングし細胞集団を定義、指定したサブポピュレーションに対する計算の適用などその他のフローサイトメトリー解析も可能
• 計算条件を解析途中に変更、即座にスクリーニングの全サンプルへ適用し再計算

Genedata Screenerがどのようにフローサイトメトリーデータ解析を効率化するか、詳細はこちらのポスターよりご確認いただけます。