発現の生データから、有益なバイオマーカーまで
Genedata Expressionist® は、研究デザインからデータ処理、統計データ解析、そして結果報告まで、すべてのプロセスを網羅したバイオマーカー探索をサポートする統合ソフトウェアで構成されています。各モジュールは、データベースおよびデータ解析コンポーネントから成り、膨大なデータと研究の処理が可能なスケーラブルなソフトウェアアーキテクチャに基づいているため、コンピュータのボトルネックを排除できます。
Expressionist モジュールは、テクノロジー関連のエキスパート、生物学者、そして生物統計学者に、高度な統計ツールとデータの可視化を提供し、異なる学問分野にまたがる研究チームのコラボレーションを促進します。ハイレベルな意志決定支援ツール、グローバルレポート、および公開機能により、情報と知識を構築し、組織全体にすばやく普及させることが可能になります。
さまざまなマイクロアレイプラットフォームから未加工データを収集し、設定可能なビジネスルールに従ってそれを処理します。柔軟なワークフロー設計により、標準化された品質管理および数千ものマイクロアレイの正規化を数分で行います。また、正規化されたマイクロアレイデータおよびプロセスの各種文書を生成します。
さまざまな MS 装置から生データを収集し、設定可能なビジネスルールに従ってそれを処理します。非常にスケーラブルなアルゴリズムにより、LC-MS/MSn、GC-MS、SELDI、SILAC、MRM、Infusion MS などのさまざまな実験装置をサポートします。
As part of the Expressionist system, Genedata is developing Refiner Genome for the integrated and whole genome analysis of RNA expression, Gene regulation, DNA methylation, SNP analysis and Copy number variation.
統計的な厳密さでデータ解析を行います。数千のサンプルとサンプルあたり数千の測定から得られたデータにより、強力な解析を可能にします。また、直観的なデータ可視化、クロスオミックスデータの総合解析のサポート、そしてバイオマーカー探索およびサンプル階層化向けの強力な予測アルゴリズムを提供します。